Verificação da atividade antiviral de Peptídeos Intragênicos Antimcrobianos (IAPs)

Nome dos Integrantes da UnB

Guilherme Dotto Brand, Éder Alves Barbosa, Thiago Viana de Freitas, Samuel Ribeiro Costa, Michele Alves dos Santos, Fernanda Leonel Silva, João Ribeiro Nunes, Enzo Matheus do Carmo, João Gabriel Resende. Pesquisadores externos: João Manuel Braz Gonçalves (iMED/University of Lisbon).

Análise do Contexto

A recent crise de Covid-19, com danos sem precedentes a saúde pública e a economia mundial escancarou a necessidade de fármacos antivirais inespecíficos capazes de servir como uma primeira linha de combate a infecções emergentes.

Breve Fundamentação Teórica

Peptídeos Intragênicos Antimicrobianos (IAPs) são fragmentos protéicos que quando sintetizados como entes individuais apresentam tropismo a membrana e capacidade de ruptura do equilírio osmótico de organismos. Estes peptídeos possuem ampla atividade antimicrobiana contra bactérias Gram-negativas, Gram-positivas, leveduras e protozoários. Dada a emergência de vírus de origem zoonótica, a maior parte deles envelopados, e a ausência de drogas específicas para o seu combate, é necessária a obtenção de moléculas de atividade ampla. IAPs possuem propriedades físico-químicas similares a peptídeos antimicrobianos, e portanto são alternativas no desenvolvimentos de compostos "lead" para o desenvolvimento de fármacos com tais características.

Objetivos e Metas

Sintetizar 3 IAPs prospectados de proteínas humanas utilizando o software Kamal. Testar, por meio de parceiros já estabelecidos, essas moléculas contra diversos tipos viriais, incluindo Influenza e SARS-CoV .

Metodologia

Busca de peptídeos usando o software Kamal: O proteoma humano padrão será descarregado a partir da página do EMBL e o software Kamal (http://www.cenargen.embrapa.br/kamal/) será utilizado para a busca de fragmentos protéicos de 16-24 resíduos de amino ácido com forma e características físico-químicas de AMPs.
Síntese química de peptídeos: Uma quantidade adequada de resina Rink será submetida a inchaço, desprotegida utilizando 4-Metilpiperidina e submetida a repetidos ciclos de acoplamento utilizando Fmoc-amino ácidos específicos adicionado de reagentes de acoplamento, como Diisopropilcarbodiimida e OxymaPure. Após a síntese da molécula, esta será clivada da resina em condições ácidas (TFA 95%) contendo sequestradores.
Ensaio in vitro de inibição de infecção por vírus em células humanas: será feita em colaboração pelo Prof. João Manuel Braz Gonçalves (https://imed.ulisboa.pt/cv/joao-manuel-braz-goncalves/) utilizando metodologia específica.

Resultados Esperados

Obtenção de peptídeos com ampla atividade inibitória da fusão de vírus em células humanas

Valor da previsão de financiamento da unidade

Cronograma da Execução

Prospecção de peptídeos: 3 meses após início do projeto
Síntese química: até 6 meses após o início do projeto
Testes in vitro: até 1 ano após o início do projeto