FORTALECIMENTO DA INFRAESTRUTURA LABORATORIAL PARA TESTAGEM DE COVID-19 E PESQUISA CIENTÍFICA

Sumário Executivo da Proposta

Propomos ações articuladas para combate ao COVID-19 na fase de crescimento rápido da curva epidêmica e no seu período subsequente para mitigar as consequências da epidemia, denominadas de FASE 1 – Fortalecimento do LACEN-DF e FASE 2 – Pesquisa Científica sobre COVID-19, respectivamente. O foco da primeira fase é melhorar a infraestrutura laboratorial do LACEN-DF para exames de qPCR para COVID-19, aumentando de 300 para 1.500 testes diários, mediante aquisição de 3 equipamentos de PCR em tempo real e três extratores de RNA automatizados. Haverá ainda área adicional externa ao LACEN-DF para segurança operacional, no Hospital das Forças Armadas (HFA), dotada também de um PCR em tempo real e de um extrator automatizado, com foco prioritário nos exames de militares e pacientes ali hospitalizados. Superada esta fase de alta demanda laboratorial, esta mesma infraestrutura será destinada a pesquisas científicas sobre as consequências do COVID-19 em doenças de interesse, a Fase 2 – Pesquisa Científica. Essa proposta estrutura-se em dois braços experimentais. Primeiro, o que tem foco na perda de olfato e paladar comumente manifestada por indivíduos positivos para COVID-19, e que investigará se: (i) esta alteração sensorial é biomarcador acurado de COVID-19; (ii) se a infecção deixará sequelas nos pacientes acometidos e; (iii) se a infeção é acompanhada de outras comorbidades. No segundo braço experimental, investigaremos se pacientes com câncer de mama positivos para COVID-19 apresentam desfechos clínicos distintos e alterações em biomarcadores moleculares de resposta terapêutica e de agressividade tumoral.
Quanto ao braço experimental 1, será conduzida uma avaliação epidemiológica de auto-relato de comorbidades e sintomas na pandemia de COVID-19 no Distrito Federal, em curso desde março de 2020, e que desafia o sistema de saúde e a economia, devido à sua alta contagiosidade. Os impactos de morbimortalidade em populações de risco ainda são baseados em estimativas provenientes dos primeiros países afetados, e de difícil previsão. Desta forma, esta pesquisa irá descrever características sintomáticas do COVID-19 e o perfil de comorbidades dos indivíduos afetados no Distrito Federal, a partir de inquérito a pacientes diagnosticados por método molecular. Trata-se de um estudo caso-controle longitudinal, em que será aplicado questionário eletrônico aos pacientes com teste RT-PCR (por swab nasofaríngeo) positivo para COVID-19 a partir de lista de notificações e seus contatos fornecida pela Secretaria de Saúde do Distrito Federal e LACEN-DF. Os pacientes fornecerão informações anônimas a respeito de sintomas que estiveram presentes, data de ocorrência de cada sintoma, comorbidades diagnosticadas, por meio de questionário elaborado em plataforma eletrônica já disponível (https://pt.surveymonkey.com/r/S93QPK3), e enviado por mensagem eletrônica. Os pacientes diagnosticados como ‘oligo ou assintomáticos’ poderão ser avaliados clinicamente e com teste de olfato 6 (seis) meses após a ‘cura virológica’. Os pacientes diagnosticados como ‘sintomáticos’ passarão pela mesma avaliação. Os dados dos sintomas serão analisados por meio de análise de cluster, método de inteligência artificial não supervisionado que realiza agrupamentos automáticos de dados segundo o seu grau de semelhança. Caso seja devidamente validado, este biomarcador será útil nas ações epidemiológicas de controle do COVID-19 particularmente em indivíduos assintomáticos ou oligossintomáticos. O conjunto de ações desta equipe de pesquisadores de diferentes instituições irá impactar diretamente no combate ao COVID-19 durante a fase das denominadas ‘espirais ascendentes’ de casos epidêmicos e no momento seguinte, onde se buscará conhecer melhor as consequências desta doença nova no Brasil e oferecer orientação médica aos indivíduos acometidos para mitigar sequelas da infecção viral.
Neste ponto descreve-se o Braço experimental 2. A pandemia observada atualmente secundária à infecção pelo COVID-19 trouxe novos desafios na avaliação do paciente oncológico. Ao sair do isolamento social preconizado pela Organização Mundial de Saúde para realizar o tratamento, o paciente pode se expor à infecção pelo COVID-19. Por outro lado, em alguns cenários, a decisão de protelar o tratamento oncológico pode implicar em mudança de prognóstico. Várias entidades médicas têm publicado orientações de como proceder nesse momento, como a Sociedade Brasileira de Oncologia Clínica (SBOC), Sociedade Brasileira de Mastologia (SBM), Colégio Brasileiro de Cirurgiões (CBC) (https://www.sboc.org.br/, https://www.sbmastologia.com.br/, https://cbc.org.br/). Essas orientações encontram respaldo apenas em opinião de especialistas e no bom senso, pois não há estudos demonstrando tanto o risco de infecção do paciente oncológico como o impacto no desfecho clínico do paciente. Pacientes oncológicos em tratamento são considerados pacientes vulneráveis para infecção pelo COVID-19. A taxa de mortalidade em pacientes portadores de câncer é o dobro da média populacional [17]. Isso pode acontecer tanto por conta do tratamento citotóxico como pelo fato de pacientes oncológicos apresentarem uma idade mediana acima de 50 anos, outro conhecido fator para o desfecho desfavorável em pacientes com infecção pelo COVID-19. O desenvolvimento de imunidade tardia, com formação de anticorpos IgG contra o vírus causador da atual pandemia, talvez venha a ser o principal fator de controle em longo prazo da atual situação [18].
Estudo conduzido na China comprova que a soroconversão dos infectados foi de 93,8%. Os níveis de anticorpos aumentaram rapidamente desde do sexto dia pós-exposição (DPO) e acompanharam o declínio da carga viral. Nesse estudo foram coletados soros seriais de pacientes com COVID-19 e detectados anticorpos totais (Ab), IgM e IgG contra SARS-CoV-2. A dinâmica do anticorpo durante a infecção foi descrita. A taxa de soroconversão para Ab, IgM e IgG em pacientes com COVID-19 foi de 98,8% (79/80), 93,8% (75/80) e 93,8% (75/80), respectivamente. O primeiro marcador de sorologia detectável é o anticorpo total e seguido por IgM e IgG, com um tempo médio de soroconversão de 15, 18 e 20 dias após a exposição (DPO) ou 9, 10 e 12 dias após o início, separadamente. Os níveis de anticorpos aumentaram rapidamente desde 6 DPO e acompanharam o declínio da carga viral. Para os pacientes no estágio inicial da doença (0-7 DPO), o Ab mostrou a maior sensibilidade (64,1%) em comparação com a IgM e a IgG (33,3% para ambos, p <0,001). As sensibilidades de detecção de Ab, IgM e IgG aumentaram para 100%, 96,7% e 93,3% duas semanas depois, respectivamente. A resposta aguda típica de anticorpos é induzida durante a infecção por SARS-CoV-2. O teste sorológico fornece complementação importante ao teste de RNA para diagnóstico específico patogênico e informações úteis para avaliar o status de imunidade adaptado do paciente. (https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.23.20041707v1). Não existem, porém, estudos demonstrando a curva de soroconversão em pacientes com câncer em tratamento, assim como não há estudos da presença de anticorpos na população oncológica assintomática e se essa soroconversão pode ter alguma influência dos genes marcadores de defeito de sistema de reparo por recombinação homóloga (BRCAness / DNA damage immune response - DDIR) no tumor ou se há algum influência do infiltrado linfocitário no estroma tumoral (tumor-infiltrating lymphocytes – sTILs).